TPP在最初发展阶段只是四个小国签订的自由贸易协定(FTA),涉及范围小,并且内容相对简单。然而在美国、澳大利亚、日本等国加入后,TPP的经济规模增大,而形势也越发复杂。各国发展相对不均衡、收入差距悬殊(如美国与越南的差距等),并且在关税上难以达成一致成为了棘手的问题。另一方面,与其他的自由贸易协定不同,TPP还涉及了知识产权、安全标准、政府采购等更深层次的问题。特别是知识产权保护、国有企业行为规范等方面仍存在较多争议。
直到2013年9月,TPP一共举行了20轮回合谈判。迄今面临的最大障碍是美日在各自开放农业和汽车行业、加大竞争方面的谈判进展缓慢。